Oxford Nanopore Technologies(簡(jiǎn)稱ONT)位于英國(guó)牛津,是全球領(lǐng)先的 納米孔測(cè)序技術(shù) 開發(fā)商。其核心技術(shù)基于對(duì)單個(gè)DNA/RNA分子通過納米孔時(shí)產(chǎn)生的電信號(hào)變化進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè),具備 長(zhǎng)讀長(zhǎng)、實(shí)時(shí)分析、便攜靈活 等優(yōu)勢(shì),顛覆了傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用場(chǎng)景。
核心創(chuàng)新:
無需擴(kuò)增:直接測(cè)序天然DNA/RNA,保留表觀修飾信息(如甲基化)。
便攜設(shè)備:部分機(jī)型可手持,適用于野外、實(shí)驗(yàn)室或臨床現(xiàn)場(chǎng)。
實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)流:邊測(cè)序邊分析,支持快速病原體鑒定或基因組組裝。
應(yīng)用廣泛:涵蓋科研、臨床診斷、農(nóng)業(yè)、環(huán)境監(jiān)測(cè)及疫情響應(yīng)(如埃博拉、COVID-19)。
Oxford Nanopore納米孔測(cè)序儀產(chǎn)品,其納米孔測(cè)序儀主要產(chǎn)品線如下:
產(chǎn)品型號(hào) | 通量/規(guī)模 | 核心特點(diǎn) | 典型應(yīng)用場(chǎng)景 |
MinION? | 低通量(1-10 Gb/運(yùn)行) | 便攜式(USB驅(qū)動(dòng))、實(shí)時(shí)分析 | 野外病原體檢測(cè)、小型基因組測(cè)序 |
MinION Mk1C? | 低通量 | 集成觸摸屏、內(nèi)置計(jì)算模塊(脫離電腦獨(dú)立運(yùn)行) | 臨床現(xiàn)場(chǎng)、移動(dòng)實(shí)驗(yàn)室 |
GridION? X5 | 中高通量(50 Gb/運(yùn)行) | 單機(jī)支持5張MinION測(cè)序芯片、自動(dòng)化流程 | 中型研究項(xiàng)目、多樣本并行測(cè)序 |
PromethION? P24/P48 | 高通量(1-7 Tb/運(yùn)行) | 24或48個(gè)獨(dú)立測(cè)序單元、支持大規(guī)模基因組項(xiàng)目 | 人類全基因組、群體測(cè)序、宏基因組 |
PromethION? P2 Solo | 靈活高通量(100-250 Gb) | 緊湊型設(shè)計(jì)、單次運(yùn)行成本優(yōu)化 | 癌癥研究、單細(xì)胞測(cè)序 |
Flongle? | 超低通量(1-2 Gb/運(yùn)行) | 低成本適配器(兼容GridION/PromethION) | 快速質(zhì)控、靶向測(cè)序驗(yàn)證 |
讀長(zhǎng):
理論讀長(zhǎng)無限制(實(shí)際中常見數(shù)十kb至Mb級(jí))。
準(zhǔn)確率:
原始單讀準(zhǔn)確率約92%-97%,通過重復(fù)測(cè)序或算法校正可達(dá)Q30+(99.9%)。
靈活性:
支持DNA、RNA、直接RNA測(cè)序及蛋白質(zhì)分析(實(shí)驗(yàn)階段)。
速度:
MinION可在6-48小時(shí)內(nèi)完成測(cè)序(依賴樣本類型)。
病原體監(jiān)測(cè):快速鑒定病毒、細(xì)菌耐藥基因。
癌癥基因組:檢測(cè)結(jié)構(gòu)變異、融合基因。
環(huán)境DNA(eDNA):生物多樣性監(jiān)測(cè)、入侵物種追蹤。
表觀遺傳學(xué):直接檢測(cè)甲基化、修飾堿基。
測(cè)序芯片:
Flow Cell:包括Flongle(低成本)、MinION R10.4(高準(zhǔn)確度)、PromethION R9.4.1(高通量)等。
分析軟件:
MinKNOW:實(shí)時(shí)控制與數(shù)據(jù)采集。
EPI2ME:云端生信分析(物種鑒定、耐藥基因預(yù)測(cè)等)。
樣本要求:需高質(zhì)量高分子量DNA(推薦 >20 kb)。
成本控制:測(cè)序芯片為消耗品,需根據(jù)通量需求選擇型號(hào)。
數(shù)據(jù)管理:高通量機(jī)型(如PromethION)需配備高性能存儲(chǔ)與計(jì)算資源。
其他注意事項(xiàng):
更詳細(xì)的技術(shù)資料需通過提供項(xiàng)目詳情獲取,歡迎咨詢。
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